Maldonado giáp Rocha về phía đông, Lavalleja về phía bắc, và Canelones về phía tây. Tây nam là sông La Plata và đông nam là biển Đại Tây Dương.

Miền bắc của bộ Maldonado là rặng núi thấp với ngọn Carape (514 m) là cao nhất. Miền trung đất đai uốn lượn trên những sườn đồi, trung bình cao khoảng 150 m. Một số sông ngòi nhỏ đa số chảy vào sông La Plata. Dọc bờ biển có những đầm phá. Đất màu tập trung ở phía tây.

Khí hậu của Maldonado thuộc vùng bán nhiệt đới nhưng tương đối mát, (trung bình khoảng 17 °C); vũ lượng hằng năm là 1.000 mm.